מענק מחקר לד"ר כפיר בר

רשות המחקר שמחה לברך את ד"ר כפיר בר מביה"ס למדעי המחשב שזכה לאחרונה במענק מחקר מטעמו של משרד המדע והטכנולוגיה, בשיתוף עם פרופ׳ נחום דרשוביץ - אוניברסיטת ת״א, פרופ׳ עידו וולף - המרכז הרפואי תל אביב ע״ש סוראסקי, ד"ר אהובה מייליק - המרכז הרפואי תל אביב ע״ש סוראסקי.

נושא המחקר הוא: חילוץ נתוני התפתחות הסרטן מתוך סיכומי מעקב חולים הכתובים בשפה העברית

תקציר: 

המסע אותו עובר המטופל האונקולוגי מרגע אבחון המחלה ולאורך ההתמודדות עמה מורכב מאירועים רבים הכוללים בדיקות, אבחון, טיפולים שונים ותופעות לוואי. מאגרי המידע הקליני הזמינים כיום מכילים נתונים חלקיים ואינם כוללים את כלל המידע אודות התהליך הרב-שלבי שתואר. עקב כך, ישנו קושי בביצוע מחקרים קליניים הדורשים שילוב של נתונים משלבים שונים במסעו המורכב של המטופל וניתוחם.  נתונים אלו אודות התהליך אותו עובר המטופל נמצאים לרוב בסיכומי הביקור אותם כותב הרופא המטפל בשפה חופשית וללא תבנית עקבית. מרבית המידע שניתן להפיק מסיכומים אלו אינו מאוגד בבסיסי נתונים או בתצורות אחרות, ועל כן ישנו צורך בפיתוח כלים חישוביים להפקתו. הכלים הנדרשים מבוססים על טכנולוגיה להבנת שפה טבעית (Natural Language Processing, NLP) בעברית, לצורך טיפול במילים רב-משמעיות אשר דורשות הפגת עמימות וטיפול במבנים מורפולוגים מורכבים הייחודיים לשפה העברית ודומותיה. פרויקט זה כולל מחקר ופיתוח של כלים אוטומטיים לחילוץ אירועים קליניים (בדיקות, אבחונים, טיפולים, תגובה לטיפול ועוד) מסיכומי ביקור מעקב דיגיטליים של חולים אונקולוגים בבית החולים איכילוב וסידורם על ציר זמן (timeline) קליני. לצורך שימוש באלגוריתמים המבוססים למידת מכונה, יבנה מאגר נתונים מסיכומי ביקור אונקולוגיים אשר בהם יתויגו אירועים שונים וסדר הופעתם, באופן ידני על ידי רופא מומחה בתחום הסרטן. הכלים והמאגרים שיפותחו בפרויקט זה יכולים לשמש בעתיד גם  לתחומי רפואה נוספים, אשר כוללים גם הם סיכומים בשפה חופשית ובלתי מובנית, כגון סיכומי מעקב וסיכומי אשפוז.